Η πατρική οικία της Χαλέπας αποτέλεσε τη στέγη της ζωής του Ελευθερίου Βενιζέλου, γι’ αυτό και φέρει την προσωπική του σφραγίδα. Το 1876 ο πατέρας του, Κυριάκος, αγόρασε το οικόπεδο στη Χαλέπα, έκτασης 2.200 τετραγωνικών μέτρων και το 1877 ξεκίνησε την οικοδόμηση της οικίας, που ολοκληρώθηκε το 1880, οπότε και εγκαταστάθηκε σε αυτήν η οικογένεια Βενιζέλου. Το 1927 η οικία απέκτησε τη σημερινή της μορφή, όταν ο Ελευθέριος επέβλεψε τη ριζική ανακαίνισή της, που πραγματοποιήθηκε με δαπάνες της δεύτερης συζύγου του, Έλενας. Μετά τον θάνατό του η οικία περιήλθε στους κληρονόμους του και αργότερα κατά τη διάρκεια της Κατοχής επιτάχθηκε από τους Γερμανούς και υπέστη σοβαρές φθορές. Την εξωτερική αποκατάσταση του κτιρίου ανέλαβε ο γιος του Σοφοκλής και έπειτα την εσωτερική συντήρηση η σύζυγος του αδελφού του, Κυριάκου, Μαρίκα Βενιζέλου. Το 2002 το Υπουργείο Οικονομικών αγόρασε την οικία από τον Νικήτα Βενιζέλο και την παραχώρησε στο Εθνικό Ίδρυμα Ερευνών και Μελετών «Ελευθέριος Κ. Βενιζέλος». Τον Μάιο του 2012, μέσω του ΕΣΠΑ και του Υπουργείου Τουρισμού, ο ΕΟΤ ανέλαβε το έργο της στατικής αποκατάστασης και της μουσειολογικής μετατροπής της οικίας σε σύγχρονο Μουσείο, το οποίο άνοιξε ξανά για το κοινό το καλοκαίρι του 2015.